AMR BRIDGE-nytt: Når bakterien oppdager skader på arvestoffet, sender den ut et SOS-signal som gjør at forsvaret prioriteres.
Slik forsvarer E. coli seg mot antibiotika (Gemini.no)
AMR BRIDGE-nytt: Når bakterien oppdager skader på arvestoffet, sender den ut et SOS-signal som gjør at forsvaret prioriteres.
– Bakteriene går i full alarm-modus, forteller NTNU-stipendiat Olaug Elisabeth Torheim Bergum.
Se for deg at du har fått en lei halsbetennelse. Du er syk, det gjør vondt, og et besøk hos legen gjør det klart at smertene skyldes en bakterieinfeksjon. Så får du resept på antibiotika, som etter kort tid tar knekken på halsondet. Du blir glad og fornøyd – men hvordan oppleves dette fra bakterienes side?
– Når vi behandler bakterier med antibiotika, påfører vi dem skader. Disse skadene kan være mye forskjellig, men ofte er det snakk om skader på arvestoffet, på DNAet. Slike skader aktiverer en SOS-respons i bakterien, sier Bergum ved Institutt for klinisk og molekylær medisin.
Ny forskning fra Universitetet i Bergen viser at hurtigtesting av pasienter i akuttmottaket kan gi bedre og mer målrettet behandling av samfunnservervet lungebetennelse. På verdensbasis er dette en av de vanligste årsakene til sykehusinnleggelser og dødsfall.
Lungebetennelse: Hurtigtesting gir raskere og mer målrettet behandling
Ny forskning fra Universitetet i Bergen viser at hurtigtesting av pasienter i akuttmottaket kan gi bedre og mer målrettet behandling av samfunnservervet lungebetennelse. På verdensbasis er dette en av de vanligste årsakene til sykehusinnleggelser og dødsfall.
Lungebetennelse er en infeksjon i lungene, vanligvis forårsaket av virus eller bakterier. Samfunnservervet lungebetennelse er lungebetennelse som oppstår utenfor helseinstitusjoner og er en av de vanligste smittsomme sykdommene, og en viktig årsak til dødelighet og sykelighet globalt. En studie publisert i JAMA Network viser at rask molekylær testing for pasienter innlagt med mistenkt samfunnservervet lungebetennelse forkorter svartiden og forbedrer av behandlingen.
Raskere diagnostikk, mer målrettet antibiotikabruk
Den randomiserte studien, gjennomført ved akuttmottaket på Haukeland universitetssykehus (HUS), sammenlignet effekten av å bruke en syndromisk PCR-basert panel for rask testing mot standard behandlingsprosedyrer. Studien viste at pasientene som ble randomisert til hurtig molekylær testing, hadde tre ganger større sjanse for å få målrettet behandling. Det var også en betydelig reduksjon i tiden til målrettet behandling.
Studien bidrar til en bedre forståelse av hvordan hurtig diagnostikk kan forbedre håndteringen av infeksjoner som lungebetennelse, potensielt føre til mer effektiv bruk av antibiotika og bedre pasientutfall. Resultatene antyder at hurtig molekylær testing, sammen med kliniske beslutningsstøtteverktøy og antibiotikastyringsprogram, kan redusere unødvendig antibiotikabruk og forbedre pasientutfall.
– Denne studien viser at rask molekylær testing kan hjelpe leger med å ta hurtigere behandlingsbeslutninger, noe som potensielt kan forbedre utfallene for pasienter med samfunnservervet lungebetennelse, sier overlege og forsker Dagfinn Markussen.
Studien er finansiert av Norges forskningsråd (NFR) og Trond Mohn Stiftelse.
Etter å ha analysert 5000 E. coli-infeksjoner fra Norge og Storbritannia i perioden 2001-2017 er resultatene entydige. Det er en klar årsakssammenheng mellom bruk av antibiotikatypen cephalosporiner og økt forekomst av den multiresistente E. coli-klonen ST131-C2.
Noen antibiotika gir mer multiresistente og sykdomsfremkallende E. coli
Etter å ha analysert 5000 E. coli-infeksjoner fra Norge og Storbritannia i perioden 2001-2017 er resultatene entydige. Det er en klar årsakssammenheng mellom bruk av antibiotikatypen cephalosporiner og økt forekomst av den multiresistente E. coli-klonen ST131-C2.
Rapporten omfattet data fra 26 europeiske land over en seksårsperiode og fikk mye oppmerksomhet, fordi den la frem en hypotese om at bruk av antibiotika driver frem økt bærerskap av antibiotikaresistente bakterier i befolkningen.
- Nå har vi for første gang bekreftet denne hypotesen. Det er en klar sammenheng mellom antibiotikabruk og økningen av de resistente variantene av bakterier i en befolkning, forklarer professor Jukka Corander som har ledet den nye studien.
Ny, bedre og billigere DNA-teknologi
På den tiden da Goossens og de andre forfatterne på 2005-studien gjorde disse funnene var bakteriegenomikken enda på vuggestadiet. Da var det bare åtte år siden den første bakterien fikk hele sin arvemasse kartlagt av vitenskapen.
Siden da har teknologien bak DNA-sekvensering gjort enorme fremskritt, og vi kan nå gjøre kartleggingen av et bakteriegenom mye raskere og rimeligere. Tidligere kunne dette ta både måneder og år og koste enorme pengesummer.
Den teknologiske utviklingen, kombinert med data fra to verdensledende nasjonale overvåkingssystemer for resistens hos mikrober, har gitt forskere ved Universitetet i Oslo, UiT Norges arktiske universitet, University of Cambridge og Sanger Institute i Cambridge muligheten til å gjøre stordataanalyser for å undersøke årsakssammenhengen mellom antibiotikabruk og antibiotikaresistens.
16 år med data
Forskerne lagde denne gangen to parallelle datasett med blodforgiftninger med E. coli-bakterier i løpet av nesten to tiår. Ett for England i perioden 2001-2017, og ett for Norge mellom 2002 og 2017.
Tilsammen har Corander og kollegene DNA-sekvensert mer enn 5000 tilfeller av blodforgiftninger for å få en mest mulig detaljert oversikt over den genetiske variasjonen og antibiotikaresistensen hos både de engelske og de norske E. coli-variantene.
- Gjennom å sammenlikne resultatene av DNA-analysene med frekvensen av antibiotikabruk i de to landene, kunne vi for første gang fastslå hvilke typer antibiotika som er spesielt viktig for framveksten av spesifikke coli-varianter med antibiotikaresistens.
Ved hjelp av omfattende datasimuleringer kunne forskerne undersøke hvordan ulike nivåer av cephalosporin-bruk henger sammen med hvor stor fremgang en bakterievariant har i befolkningen.
- Vår konklusjon er at mer utstrakt bruk av antibiotikatypen cephalosporiner i England enn i Norge har ført til høyere forekomst av infeksjoner av den multiresistente coli-varianten ST131-C2 i det engelske samfunnet. Denne varianten er en bekymring for infeksjonsmedisin fordi den er multiresistent og at den er betydelig mer virulent og forårsaker flere infeksjoner enn andre varianter, som vi viste nylig i en annen studie.
Anbefaler nasjonale overvåkingssystemer
Studien illustrerer hvor viktig det er med nasjonale overvåkingssystemer for antibiotikaresistens. Ved hjelp av analyser av representativt datamateriale over en årrekke er det mulig å trekke entydige konklusjoner om de ulike faktorenes betydning for utviklingen av antibiotikaresistens.
- Når vi kombinerer bakterieprøver fra ulike overvåkingssystemer med avansert statistikk og den nyeste teknologien for DNA-analyser, så kan forskningen bidra med viktig forståelse i kampen mot antibiotikaresistens, slår Jukka Corander fast.
Om studien
Forskerne har tatt utgangspunkt i mer enn 5000 E .coli-prøver fra nasjonale overvåkingssystemer i Norge (NORM – Norsk overvåkingssystem for antibiotikaresistens hos mikrober) fra 2002-2017, og i Storbritannia (British Society for Antimicrobial Chemotherapy, BSAC) fra 2012-2017, kombinert med publiserte data fra Storbritannia i perioden 2001-2011.
Arbeidet har inkludert forskere fra Universitetet i Oslo, UiT Norges arktiske universitet, Turku universitetssykehus, Ninewells Hospital and Medical School i Skottland, Universitetssykehuset Nord-Norge, Imperial College London, University of Birmingham, og University of Cambridge.
Arbeidet ble finansiert av den norske Trond Mohn stiftelsen gjennom AMR BATTALION-prosjektet, Marie Sklodowska-Curie Actions og Det europeiske forskningsrådet (ERC). Genomsekvenseringen ble gjort ved Wellcome Sanger Institute i Storbritannia.
«Modulation of multidrug-resistant clone success in Escherichia coli populations: a longitudinal, multi-country, genomic and antibiotic usage cohort study»
Ved NTNU har man nå en lovende kandidat for antibiotika mot resistente gule stafylokokker. Bak funnet ligger metodikk som kan bli viktig i kampen mot antibiotika-resistens.
Gemini: Ny metode baner vei for nye antibiotika
Ved NTNU har man nå en lovende kandidat for antibiotika mot resistente gule stafylokokker. Bak funnet ligger metodikk som kan bli viktig i kampen mot antibiotika-resistens.
– Antibiotika-resistens er et stort problem. Å kunne bidra til å løse det er veldig kjekt, sier stipendiat Amanda Holstad Singleton.
Hun er førsteforfatter på en studie som viser hvordan to nye stoffer i kombinasjon effektivt dreper antibiotikaresistente gule stafylokokker (MRSA).
Stoffene er utviklet på NTNU og kan bli et helt nytt antibiotikum, effektivt mot en bred gruppe bakterier.
– En ting er at vi har utviklet nye antibiotika-kandidater, som i kombinasjon viser seg å tolereres godt av menneskelige celler. Men like viktig er det at vi har utviklet en teknologi for å studere hvordan antibiotikumet virker inne i bakteriecellene, sier Singleton.
En ny studie viser at det er mye antibiotikaresistent Klebsiella på sykehus, mens omfanget er mye mindre utenfor sykehusene.
Ghana: Mye Klebsiella-resistens i sykehus, lite ellers i samfunnet
En ny studie viser at det er mye antibiotikaresistent Klebsiella på sykehus, mens omfanget er mye mindre utenfor sykehusene.
Det verdensomspennende problemet med antibiotikaresistens hos bakterier er forventet å gi de mest alvorlige konsekvensene i utviklingsland. Det er også i disse landene vi har de dårligste vitenskapelige dataene på utbredelsen av antibiotikaresistente bakterier.
For å bøte på problemet samlet forskere ved Universitetet i Oslo i 2019 og 2020 inn prøver fra pasienter på sykehuset, fra miljøet ellers og fra dyr i og rundt Ghanas tredje største by Tamale. Formålet var å undersøke omfanget av antibiotikaresistens hos Klebsiella og få bedre data rundt problemet med antibiotikaresistens i disse bakterieartene i det afrikanske landet.
Ikke-resistent Klebsiella vinner utenfor sykehus
Prøvene som forskerne samlet inn viste at en stor andel av Klebsiella-stammene som ble funnet på sykehuset i Tamale hadde mekanismer som gjorde dem resistente mot antibiotika.
På den andre siden er det positivt at forskerne fant få Klebsiella pneumoniae-bakterier med multiresistens mot antibiotika utenfor sykehusmiljøet, altså i samfunnet ellers og hos dyr. Det betyr at de resistente bakteriene ikke klarer seg like bra i konkurransen mot ikke-resistente Klebsiella, fordi seleksjonstrykket fra antibiotika uteblir.
Dermed vil ikke de antibiotikaresistente variantene spre seg like godt mellom ulike miljøer.
- Studien påviser styrken hos helgenom-sekvensering og avanserte analysemetoder som den eneste veien til å finne hvordan bakterier klarer seg i ulike økologiske miljøer, og for å finne ut hvilke konsekvenser menneskelig aktivitet har på spredningen av disse bakteriene.
Jukka Corander, professor ved Universitetet i Oslo
Ghana og Italia genetisk like
Prøvene ble analysert både gjennom hvor mottakelige de var for antibiotika, og ved analyser av hele genmaterialet til bakteriene (helgenom-sekvensering). Prøvesvarene ble også sammenliknet med data fra befolkningsundersøkelser i Pavia i Italia og fra Tromsø i Nord-Norge.
I alt ble 573 Klebsiella-prøver DNA-sekvensert, og 370 av disse viste seg å være versting-varianten Klebsiella pneumoniae som er en hyppig årsak til sykehusinfeksjoner. Den kan forårsake alvorlig sykdom blant annet hos eldre og svake pasienter.
Analysene viste også at antibiotikaresistens var mer utbredt i det afrikanske og i det sør-europeiske prøvematerialet enn i det norske.
Studien ble finansiert av det europeiske forskningsrådet, det finske forskningsrådet, Trond Mohn stiftelse gjennom deres nasjonale forskningsprogram på antibiotikaresistens, og The Wellcome Trust i England.
Én-helse, eller One Health, er en tilnærming for å lage og gjennomføre programmer, politikk, lovgivning og forskning der flere sektorer kommuniserer og jobber sammen for å oppnå bedre folkehelse.
Bekjempelse av nye helsetrusler, matbårne sykdommer, sykdommer som kan smitte mellom dyr og mennesker (zoonoser) og antibiotikaresistens er alle sentrale arbeidsområder i Én-helse.
Målrettede angrep på E. coli-bakteriens beskyttende kapsel kan bidra til å forebygge og behandle alvorlige infeksjoner i blodet, viser ny studie.
Ny studie kan bane vei for effektiv behandling av E. coli-infeksjon
Målrettede angrep på E. coli-bakteriens beskyttende kapsel kan bidra til å forebygge og behandle alvorlige infeksjoner i blodet, viser ny studie.
Professor Jukka Corander ved Universitetet i Oslo (UiO). Sammen med kollega Sergio Arredondo-Alonso har han vært sentral i å avdekke K1-kapselen som E. coli-bakteriene beskytter seg med. Foto: Mona Mehus, UiO
E. coli-bakterien har en ytre, beskyttende kapsel. Det er denne som er ansvarlig for at bakterien kan føre til sykdom. En ny studie publisert i Nature Communications viser hvordan målrettet behandling mot det beskyttende skallet kan bidra til å behandle infeksjoner i kroppen vår.
Forekomsten av antibiotikaresistens her i Norge er fortsatt lav, og salget av antibiotika til landdyr er på sitt laveste nivå på 300 år.
Effektive antibiotikatiltak har gitt gode resultater
Forekomsten av antibiotikaresistens her i Norge er fortsatt lav, og salget av antibiotika til landdyr er på sitt laveste nivå på 300 år.
Det viser tall for 2022 fra Norsk overvåkingssystem for antibiotikaresistens hos mikrober (NORM).
– Den lave forekomsten av antibiotikaresistens i Norge skyldes lavt forbruk av antibiotika, et fordelaktig forbruksmønster og effektive tiltak mot spredning av resistente bakterier, sier Gunnar Skov Simonsen, som leder NORM. Han er tilknyttet Universitetetssykehuset i Nord-Norge og FHI.
Antibiotikaresistens hos dyr i Norge er heller ikke et stort problem, viser NORM-VET som publiserer sammen med NORM-rapporten.
– At vi fortsatt har en god situasjon både når det gjelder resistens og forbruk, viser at det gjøres mye godt arbeid på mange nivåer i Norge, fra dyreeier og næringsorganisasjoner, til veterinæren, kunnskapsstøtteinstitusjonene og opp til myndighetene. Sykdomstrusler og zoonoser, mer resistente bakterier i andre land og på humansiden, understreker betydningen av å følge utviklingen nøye også framover, sier administrerende direktør Torill Moseng ved Veterinærinstituttet.
Skjær i sjøen
FHI ser imidlertid en økning i forekomst av en bakterietype hos mennesker som er svært krevende å behandle. Samtidig med NORM-VET-rapporten, publiserer FHI også årsrapport for 2022 for overvåkningen av antibiotikaresistens fra Meldingssystem for smittsomme sykdommer (MSIS)
Tall fra rapportene viser at det var en markant økning i antall personer smittet med karbapenemase-produserende bakterier (CPO), sammenlignet med 2021 og tidligere år. Dette er en bakterietype som er svært resistente mot effektiv antibiotikabehandling. Økningen ses også i andre land i Europa. Foreløpig har det vært få utbrudd med disse bakteriene i Norge.
– CPO er bakterier som kan gi behandlingskrevende infeksjoner, samtidig som bakteriene kan spre seg i helsetjenesten og føre til at flere personer smittes. Per i dag har vi veldig begrensede, noen ganger ingen effektive antibiotika som fungerer, sier overlege Miriam Sare ved FHI.
En mye brukt kreftmedisin kan gjøre bakterier motstandsdyktige mot antibiotika i laboratoriet, viser en norsk studie. Men mer forskning må til før vi vet om det samme skjer i pasienter.
Rundt oss vokser antallet med antibiotikaresistente bakterier. Dette er bakterier som lærer seg å tåle alt, og som det ikke finnes noen kur mot. Men i fagmiljøene jobbes det godt, blant annet på laboratoriet til Nasjonal kompetansetjeneste for påvisning av antibiotikaresistens (K-res) ved UNN Tromsø.
Jukka Corander og hans team ved UiO publiserer sykehusbakterienes historie i Nature - den er lengre enn du kanskje tror. Corander leder et av prosjektene i Trond Mohn stiftelse og Tromsø forskningsstiftelse sitt AMR-program.
Jukka Corander og hans team ved UiO publiserer sykehusbakterienes historie i Nature - den er lengre enn du kanskje tror. Corander leder et av prosjektene i Trond Mohn stiftelse og Tromsø forskningsstiftelse sitt AMR-program.
The AMR-Bridge Annual meeting was taking place 13-15 October at Jægtvolden.
The 2020 scientific topic meeting adressed "The need for new antibiotics" and was hosted by The Norwegian University of Science and Technology (NTNU), represented by Marit Otterlei. Otterlei is the project leader of TAMiR (Targeting AMR by inibition og bacterial stress responses), one of the AMR-projects funded by TMF.
Some of the presentations from the meeting can be found here:
The AMR-Bridge annual meeitng was arranged in association with the scientific topic meeiting. In addition to presentations from all partners, Gunnar Skov Simonsen from NORM (Norsk overvåkningssystem for antibiotikaresistens hos mikrober), gave a presentation tittled"AMR situation in Norway in a global context".
Science Communication was also a topic at the annual meeting and Professor Jo Røyslien (UiO) introduced this session by giving a presentation tittled "The importance of innovation in science communication", followed by discussions.
Representatives from all AMR-Bridge partners attending the Annual AMR-Bridge meeting 2020. Foto: Jægtvolden